PanTA: Giải pháp đột phá trong việc phân tích pangenome quy mô lớn cho hệ vi sinh vật
Bài báo giới thiệu kết quả phát triển PanTA, một gói phần mềm tiên tiến giúp phân tích đa hệ gen (pangenome) từ các bộ dữ liệu vi khuẩn khổng lồ với hiệu suất vượt trội so với các công cụ hiện có. PanTA sử dụng cơ chế mới, cho phép xây dựng pangenome theo một phương pháp tiên tiến mà không cần tái tạo từ đầu, giúp giảm thiểu đáng kể tài nguyên bộ nhớ dùng cho tính toán. Phần mềm này là mã nguồn mở và sẵn sàng cho cộng đồng khoa học sử dụng.
Điều đặc biệt là một phần quan trọng trong bài báo này là kết quả Khóa luận tốt nghiệp của SV Nguyễn Tiến Anh K72, với sự hướng dẫn của PGS. TS. Phùng Thanh Hương, Khoa CNSH và nhóm nghiên cứu AROMICS.
Bài báo được công bố trên tạp chí Genome Biology, IF 10.1, là tạp chí đứng thứ 3 trong lĩnh vực Di truyền học và đứng thứ 2 trong lĩnh vực Công nghệ sinh học và vi sinh học ứng dụng, theo xếp hạng của Thomson Reuters.
Link bài báo: https://doi.org/10.1186/s13059-024-03362-z
10-09-2024
